Vorlesung: Theoretical and Computational Biophysics - Details

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Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname Vorlesung: Theoretical and Computational Biophysics
Untertitel
Veranstaltungsnummer 340232
Semester WiSe 2023/24
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden 4
maximale Teilnehmendenanzahl 30
notwendige Teilnehmeranzahl 3
Heimat-Einrichtung Göttinger Graduiertenzentrum für Neurowissenschaften, Biophysik und molekulare Biowissenschaften (GGNB)
beteiligte Einrichtungen Georg-August University School of Science (GAUSS) (für Mathematik und Naturwissenschaften)
Veranstaltungstyp Vorlesung in der Kategorie Lehre
Erster Termin Montag, 23.10.2023 16:00 - 17:30
Art/Form
Voraussetzungen Basic knowledge in physics is preferred, programing skills are not required. For interested students the subsequent lecture “Biomolecular Physics and Simulations (A170)“ is recommended in the following semester.

Räume und Zeiten

Keine Raumangabe
Montag: 16:00 - 17:30, wöchentlich(14x)

Studienbereiche

Kommentar/Beschreibung

This combined lecture and hands-on computer tutorial focuses on the basics of computational biophysics and deals with questions like “How can the particle dynamics of thousands of atoms be described precisely?” or “How does a sequence alignment algorithm work?” No cell could live without the highly specialized macromolecules. Proteins enable virtually all tasks in our bodies, e.g. photosynthesis, motion, signal transmission and information processing, transport, sensor system, and detection. The perfection of proteins had already been highly developed two billion years ago.
The aim of the lecture is to develop a physical understanding of those “nano maschines” by using modern concepts of non-equilibrium thermodynamics and computer simulations on the dynamics on an atomic scale. Moreover, the lecture shows (by means of examples from current research) how computers can be used in modern biophysics, e.g. to simulate the dynamics of biomolecular systems, molecular charge transfer or to calculate or refine a protein structure.
During the exercises, the knowledge presented in the lecture is to practical examples to further deepen and strengthen the understanding. By completing homework sets, which are distributed after each lecture, additional aspects of the addressed topics during the lecture shall be worked out. The homework sets are collected during the corresponding exercises.

Organisatorial details:
The course will alternate between two rooms in the Physics Faculty: Lectures take place in a lecture hall and the hands-on computer tutorial takes place in a computer room, Friedrich-Hund-Platz 1, 37077 Göttingen. The room numbers will be announced in due time. Please check the StudIP entry regularly.

All participants need an individual account to access the CIP-Pool computers of the Physics Faculty: Please contact the CIP-Pool administrator < support@cip.physik.uni-goettingen.de > or the tutor (will be announced in StudIP) in advance if you do not have one yet.



Important:

Once participation has become binding after the signing-out period, cancellation is only possible via the GGNB or GAUSS Office with a) sick certificate, or b) statement by supervisor for scientific reasons. If you do not provide this, you will be excluded from courses for the next 12 months, as well as travel grants and other financial support. No exceptions.

By signing up you agree (1) to carefully check whether you will be able to attend the course (do not register for 2 courses taking place on the same dates - the above mentioned sanctions apply!), (2) to frequently check your student e-mail account, as all information on courses will exclusively be sent to that account; (3) that your name and e-mail address may be forwarded to the course instructor(s) for communication before and after the course; (4) to complete the course evaluation; (5) inform us if you no longer wish to maintain a waiting list position.

Anmelderegeln

Diese Veranstaltung gehört zum Anmeldeset "GGNB_Methods_2023_WiSe_August_Oktober".
You can register and sign out for methods courses in October 2023 from 1-20 August 2023. The slots will be assigned around 25 August 2023.
In exceptional circumstances, you can still sign out until 31 August 2023.
Your participation becomes binding on 1 September 2023. Thereafter, cancellation is only possible via the GGNB Office with a) sick certificate, or b) statement by supervisor (for scientific reasons). If you do not provide this, you will be excluded from courses for the next 12 months, as well as travel grants and other financial support.

By signing up you agree (1) to carefully check whether you will be able to attend the course (do not register for 2 courses taking place on the same dates – the above mentioned sanctions apply!), (2) to frequently check your student e-mail account, as all information on courses will exclusively be sent to that account; (3) that your name and e-mail address may be forwarded to the course instructor(s) for communication before and after the course; (4) to complete the course evaluation.
Folgende Regeln gelten für die Anmeldung:
  • Die Anmeldung ist möglich von 01.08.2023, 00:00 bis 20.08.2023, 23:59.
  • Die Anmeldung zu maximal 2 Veranstaltungen des Anmeldesets ist erlaubt.
  • Mindestens eine der folgenden Bedingungen muss zur Anmeldung erfüllt sein:
    • Abschluss ist Promotion m.Abschlussprfg
    • Abschluss ist PromStudiengang Cotutelle
    • Abschluss ist Promotion Cotutelle
    • Abschluss ist Promotionsstudiengang
    • Abschluss ist Promotionsprogramm
    • Abschluss ist PromProgramm Cotutelle
  • Es wird eine festgelegte Anzahl von Plätzen in den Veranstaltungen verteilt.
    Die Plätze in den betreffenden Veranstaltungen wurden am 25.08.2023 um 23:59 verteilt. Weitere Plätze werden evtl. über Wartelisten zur Verfügung gestellt.
  • Mindestens eine der folgenden Bedingungen muss zur Anmeldung erfüllt sein:
    • Studienfach ist Neurowissenschaften
    • Studienfach ist Physik
    • Studienfach ist IRTG 2172 - PRoTECT
    • Studienfach ist Psychologie
    • Studienfach ist Genes in Development, Disease and Evolution
    • Studienfach ist Mathematical Sciences
    • Studienfach ist PhysicsBiologComplexSyste
    • Studienfach ist Cardiovascular Science
    • Studienfach ist Molekulare Medizin
    • Studienfach ist Biologische Diversität und Ökologie
    • Studienfach ist Geoscience
    • Studienfach ist Emerging Infect. Diseases
    • Studienfach ist Geography
    • Studienfach ist Computer Science -PCS-
    • Studienfach ist Biologie
    • Studienfach ist Catalysis Sust.Synt.CaSuS
    • Studienfach ist SensoryMotor Neuroscience
    • Studienfach ist BioNutz-MolwissBiotechnol
    • Studienfach ist Umweltinformatik
    • Studienfach ist Biomol:Struc-Func-Dynamic
    • Studienfach ist Geographie
    • Studienfach ist Systems Neuroscience
    • Studienfach ist Behavior and Cognition
    • Studienfach ist Genome Science
    • Studienfach ist Theoret Computat Neurosci
    • Studienfach ist Environmental Informatics
    • Studienfach ist Materialforschung Holz
    • Studienfach ist Molekulare Biologie
    • Studienfach ist MolecularBiology of Cells
    • Studienfach ist MetalSites i.Biomolecules
    • Studienfach ist Environmental Informatics
    • Studienfach ist MolecularPhysi oftheBrain
    • Studienfach ist Chemie
    • Studienfach ist Microbiology-Biochemistry
Veranstaltungszuordnung:

Anmeldemodus

Die Anmeldung ist verbindlich, Teilnehmende können sich nicht selbst austragen.