Blockveranstaltung: Introduction to neural data analysis with Python - Details

Blockveranstaltung: Introduction to neural data analysis with Python - Details

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Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname Blockveranstaltung: Introduction to neural data analysis with Python
Untertitel
Veranstaltungsnummer 340455
Semester SoSe 2024
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden 6
maximale Teilnehmendenanzahl 8
notwendige Teilnehmeranzahl 4
Heimat-Einrichtung Göttinger Graduiertenzentrum für Neurowissenschaften, Biophysik und molekulare Biowissenschaften (GGNB)
Veranstaltungstyp Blockveranstaltung in der Kategorie Lehre
Erster Termin Mittwoch, 24.04.2024 09:00 - 17:00
Art/Form
Sonstiges The course will take place in presence (Research Group Sensory Processing in the Retina
Waldweg 33, 37073 Göttingen) in April/May 2024 (exact dates are tba) and will be given by Robert Mihai Haret and Shashwat Sridhar.

Räume und Zeiten

Keine Raumangabe
Mittwoch, 24.04.2024 09:00 - 17:00
Donnerstag, 25.04.2024 09:00 - 17:00
Freitag, 26.04.2024 09:00 - 17:00

Studienbereiche

Kommentar/Beschreibung

Neuroscientists often employ computational and statistical methods to analyse the structure of neuronal spike trains and their relation to sensory stimuli. In this course, we will introduce basic methods for analysing recorded neural data (including spike trains and voltage traces) with the programming language Python. The course will also include a brief introduction to Python, so no prior programming experience is required.



We will work on data recorded in our lab from retinal ganglion cells of mice and/or salamanders under visual stimulation. Through explanations and practical exercises, we will explore how to load, visualise and process recorded data to infer the tuning and filtering characteristics of neurons. Topics include the computation of firing rate profiles, interspike interval distributions, spike-triggered averages, tuning curves, and detection of particular cell classes (e.g. direction-selective cells). Participants will be guided to tackle analysis problems of varying difficulty, depending on their background in computer programming and data analysis.



Participants are encouraged to bring their own data; the end of the course will be dedicated to helping the participants apply the acquired techniques and start working with Python in their own projects.

The course room will be wheelchair accessible.


Important:

Once participation has become binding after the signing-out period, cancellation is only possible via the GGNB or GAUSS Office with a) sick certificate, or b) statement by supervisor for scientific reasons. If you do not provide this, you will be excluded from courses for the next 12 months, as well as travel grants and other financial support. No exceptions.

By signing up you agree (1) to carefully check whether you will be able to attend the course (do not register for 2 courses taking place on the same dates - the above mentioned sanctions apply!), (2) to frequently check your student e-mail account, as all information on courses will exclusively be sent to that account; (3) that your name and e-mail address may be forwarded to the course instructor(s) for communication before and after the course; (4) to complete the course evaluation; (5) inform us if you no longer wish to maintain a waiting list position; (6) that you only receive credits for attending the entire workshop - you will not get partial credits for part-time attendance.

Anmelderegeln

Diese Veranstaltung gehört zum Anmeldeset "GGNB_Methods_2024_SoSe_Februar_April".
You can register and sign out for methods courses in April 2024 from 1-20 February 2024. The slots will be assigned around 25 February 2024.
In exceptional circumstances, you can still sign out until 29 February 2024.
Your participation becomes binding on 1 March 2024. Thereafter, cancellation is only possible via the GGNB Office with a) sick certificate, or b) statement by supervisor (for scientific reasons). If you do not provide this, you will be excluded from courses for the next 12 months, as well as travel grants and other financial support.

By signing up you agree (1) to carefully check whether you will be able to attend the course (do not register for 2 courses taking place on the same dates – the above mentioned sanctions apply!), (2) to frequently check your student e-mail account, as all information on courses will exclusively be sent to that account; (3) that your name and e-mail address may be forwarded to the course instructor(s) for communication before and after the course; (4) to complete the course evaluation.
Folgende Regeln gelten für die Anmeldung:
  • Mindestens eine der folgenden Bedingungen muss zur Anmeldung erfüllt sein:
    • Abschluss ist Promotionsprogramm
    • Abschluss ist Promotionsstudiengang
    • Abschluss ist Promotion m.Abschlussprfg
    • Abschluss ist PromProgramm Cotutelle
    • Abschluss ist PromStudiengang Cotutelle
    • Abschluss ist Promotion Cotutelle
  • Es wird eine festgelegte Anzahl von Plätzen in den Veranstaltungen verteilt.
    Die Plätze in den betreffenden Veranstaltungen wurden am 25.02.2024 um 23:59 verteilt. Weitere Plätze werden evtl. über Wartelisten zur Verfügung gestellt.
  • Die Anmeldung zu maximal 2 Veranstaltungen des Anmeldesets ist erlaubt.
  • Mindestens eine der folgenden Bedingungen muss zur Anmeldung erfüllt sein:
    • Studienfach ist MetalSites i.Biomolecules
    • Studienfach ist Behavior and Cognition
    • Studienfach ist IRTG 2172 - PRoTECT
    • Studienfach ist Genes in Development, Disease and Evolution
    • Studienfach ist Chemie
    • Studienfach ist Microbiology-Biochemistry
    • Studienfach ist MolecularPhysi oftheBrain
    • Studienfach ist Molekulare Medizin
    • Studienfach ist Genome Science
    • Studienfach ist Systems Neuroscience
    • Studienfach ist Mathematical Sciences
    • Studienfach ist Physik
    • Studienfach ist Catalysis Sust.Synt.CaSuS
    • Studienfach ist Cardiovascular Science
    • Studienfach ist Geographie
    • Studienfach ist Theoret Computat Neurosci
    • Studienfach ist SensoryMotor Neuroscience
    • Studienfach ist Environmental Informatics
    • Studienfach ist Biologische Diversität und Ökologie
    • Studienfach ist Umweltinformatik
    • Studienfach ist Molekulare Biologie
    • Studienfach ist Emerging Infect. Diseases
    • Studienfach ist Biologie
    • Studienfach ist Geography
    • Studienfach ist Environmental Informatics
    • Studienfach ist Computer Science -PCS-
    • Studienfach ist PhysicsBiologComplexSyste
    • Studienfach ist Biomol:Struc-Func-Dynamic
    • Studienfach ist MolecularBiology of Cells
    • Studienfach ist Geoscience
    • Studienfach ist BioNutz-MolwissBiotechnol
    • Studienfach ist Materialforschung Holz
    • Studienfach ist Psychologie
    • Studienfach ist Neurowissenschaften
  • Die Anmeldung ist möglich von 01.02.2024, 00:00 bis 20.02.2024, 23:59.
Veranstaltungszuordnung:

Anmeldemodus

Die Anmeldung ist verbindlich, Teilnehmende können sich nicht selbst austragen.