Vorlesung mit Übung: Biomolecular Physics and Simulations - Details

Vorlesung mit Übung: Biomolecular Physics and Simulations - Details

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Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname Vorlesung mit Übung: Biomolecular Physics and Simulations
Untertitel
Veranstaltungsnummer 340204
Semester SoSe 2024
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden 3
maximale Teilnehmendenanzahl 30
notwendige Teilnehmeranzahl 3
Heimat-Einrichtung Göttinger Graduiertenzentrum für Neurowissenschaften, Biophysik und molekulare Biowissenschaften (GGNB)
Veranstaltungstyp Vorlesung mit Übung in der Kategorie Lehre
Erster Termin Montag, 08.04.2024 16:00 - 17:30
Art/Form

Räume und Zeiten

Keine Raumangabe
Montag: 16:00 - 17:30, wöchentlich(13x)

Studienbereiche

Kommentar/Beschreibung

This combined lecture and hands-on computer tutorial is the continuation of the lecture “Theoretical and Computational Biophysics” (usually taking place in the previous winter term) and offers the possibility to deepen the knowledge about theory and computer simulations of biomolecular systems, particularly proteins. During the exercises, the knowledge presented in the lecture is applied to practical examples to further deepen and strengthen the understanding. By completing homework sets, which are distributed after each lecture, additional aspects of the addressed topics during the lecture shall be worked out. The homework sets are collected during the corresponding exercises.

Whereas the lecture “Theoretical and Computational Biophysics” emphasized the principles of running and analyzing simple atomistic force field-based simulations, this advanced course will broaden our view and introduce concepts and methods particularly required to understand biomolecular function, namely thermodynamic quantities such as free energies and affinities. Further, inclusion of quantum mechanical simulation techniques will allow to also simulate chemical reactions, e.g., in enzymes.

The following topics will be introduced and further discussed: Quantum mechanical methods, Hartree-Fock and Density Functional Theory, Rate Theory, Non-equilibrium thermodynamics, Charge transfer and photosynthesis, Free energy calculations.

Organisatorial details:

Online:
Details on how the online lecture/the online practical are organized will be announced in due time. Please check the StudIP entry regularly.

In Presence:
The course will alternate between two rooms in the Physics Faculty: Lectures take place in a lecture hall and the hands-on computer tutorial takes place in a computer/seminar room, Friedrich-Hund-Platz 1, 37077 Göttingen. The room numbers will be announced in due time.

In both cases, virtual or on-site class, participants need an individual account to access the CIP-Pool computers of the Physics Faculty: Please contact the CIP-Pool administrator < support@cip.physik.uni-goettingen.de > or the tutor (will be announced in StudIP) in advance


Important:

Once participation has become binding after the signing-out period, cancellation is only possible via the GGNB or GAUSS Office with a) sick certificate, or b) statement by supervisor for scientific reasons. If you do not provide this, you will be excluded from courses for the next 12 months, as well as travel grants and other financial support. No exceptions.

By signing up you agree (1) to carefully check whether you will be able to attend the course (do not register for 2 courses taking place on the same dates - the above mentioned sanctions apply!), (2) to frequently check your student e-mail account, as all information on courses will exclusively be sent to that account; (3) that your name and e-mail address may be forwarded to the course instructor(s) for communication before and after the course; (4) to complete the course evaluation; (5) inform us if you no longer wish to maintain a waiting list position; (6) that you only receive credits for attending the entire workshop - you will not get partial credits for part-time attendance.

Anmelderegeln

Diese Veranstaltung gehört zum Anmeldeset "GGNB_Methods_2024_SoSe_Februar_April".
You can register and sign out for methods courses in April 2024 from 1-20 February 2024. The slots will be assigned around 25 February 2024.
In exceptional circumstances, you can still sign out until 29 February 2024.
Your participation becomes binding on 1 March 2024. Thereafter, cancellation is only possible via the GGNB Office with a) sick certificate, or b) statement by supervisor (for scientific reasons). If you do not provide this, you will be excluded from courses for the next 12 months, as well as travel grants and other financial support.

By signing up you agree (1) to carefully check whether you will be able to attend the course (do not register for 2 courses taking place on the same dates – the above mentioned sanctions apply!), (2) to frequently check your student e-mail account, as all information on courses will exclusively be sent to that account; (3) that your name and e-mail address may be forwarded to the course instructor(s) for communication before and after the course; (4) to complete the course evaluation.
Folgende Regeln gelten für die Anmeldung:
  • Mindestens eine der folgenden Bedingungen muss zur Anmeldung erfüllt sein:
    • Abschluss ist Promotionsprogramm
    • Abschluss ist Promotionsstudiengang
    • Abschluss ist Promotion m.Abschlussprfg
    • Abschluss ist PromProgramm Cotutelle
    • Abschluss ist PromStudiengang Cotutelle
    • Abschluss ist Promotion Cotutelle
  • Es wird eine festgelegte Anzahl von Plätzen in den Veranstaltungen verteilt.
    Die Plätze in den betreffenden Veranstaltungen wurden am 25.02.2024 um 23:59 verteilt. Weitere Plätze werden evtl. über Wartelisten zur Verfügung gestellt.
  • Die Anmeldung zu maximal 2 Veranstaltungen des Anmeldesets ist erlaubt.
  • Mindestens eine der folgenden Bedingungen muss zur Anmeldung erfüllt sein:
    • Studienfach ist MetalSites i.Biomolecules
    • Studienfach ist Behavior and Cognition
    • Studienfach ist IRTG 2172 - PRoTECT
    • Studienfach ist Genes in Development, Disease and Evolution
    • Studienfach ist Chemie
    • Studienfach ist Microbiology-Biochemistry
    • Studienfach ist MolecularPhysi oftheBrain
    • Studienfach ist Molekulare Medizin
    • Studienfach ist Genome Science
    • Studienfach ist Systems Neuroscience
    • Studienfach ist Mathematical Sciences
    • Studienfach ist Physik
    • Studienfach ist Catalysis Sust.Synt.CaSuS
    • Studienfach ist Cardiovascular Science
    • Studienfach ist Geographie
    • Studienfach ist Theoret Computat Neurosci
    • Studienfach ist SensoryMotor Neuroscience
    • Studienfach ist Environmental Informatics
    • Studienfach ist Biologische Diversität und Ökologie
    • Studienfach ist Umweltinformatik
    • Studienfach ist Molekulare Biologie
    • Studienfach ist Emerging Infect. Diseases
    • Studienfach ist Biologie
    • Studienfach ist Geography
    • Studienfach ist Environmental Informatics
    • Studienfach ist Computer Science -PCS-
    • Studienfach ist PhysicsBiologComplexSyste
    • Studienfach ist Biomol:Struc-Func-Dynamic
    • Studienfach ist MolecularBiology of Cells
    • Studienfach ist Geoscience
    • Studienfach ist BioNutz-MolwissBiotechnol
    • Studienfach ist Materialforschung Holz
    • Studienfach ist Psychologie
    • Studienfach ist Neurowissenschaften
  • Die Anmeldung ist möglich von 01.02.2024, 00:00 bis 20.02.2024, 23:59.
Veranstaltungszuordnung:

Anmeldemodus

Die Anmeldung ist verbindlich, Teilnehmende können sich nicht selbst austragen.